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【与榜样同行】医学与信息技术结合的经验分享

来源:教育处 发布时间:2021-05-19 浏览次数:
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黄宇亮

放射治疗科

硕士研究生

 

我本人比较早来到肿瘤医院参加科研,大概是还在北医读大四的时候,正式确定加入放疗科张艺宝老师的团队。比较早起步有很多好处,比如正常研究生一年级需要掌握的基础知识,我在入学前就已经很熟悉了,而且入学前还做了一年的科研发了第一篇SCI。在肿瘤医院学习期间,我以共同一作的身份总共发表了7篇SCI,非常感谢我的导师及肿瘤医院的科研环境,使我有较多的产出,也凭借比较丰富的科研经历顺利申请到了美英加三国的博士项目,毕业后我将接受英国EPSRC的资助,在伦敦大学学院(UCL)攻读医学图像分析博士学位。

回首我的科研经历,我觉得交叉学科将会得到越来越多的关注,在医学领域,有很多问题能结合计算机和数理知识来寻找新的解决方案,其中计算机或者说机器学习辅助医疗决策将会是以后的大趋势,在此我分享下个人理工医交叉的一点经验。

首先,计算机程序可以帮助你实现实验流程的自动化。在我入组以前,我们课题组分析放疗计划的剂量数据,往往需要人工抄写,不仅耗时较长,而且也有可能记错。后来我通过编写脚本程序,可以自动获取临床数据库中的数据,而且进行一定的后处理。我们科室的病例总共有三万例,有时候要选取一部分患者,通过脚本程序可以很轻松的完成病例筛选。

其次,遇到技术难题可以多看stackoverflow等国外的计算机论坛。中文论坛有时候也提供很不错的资料,但大部分情况下并不如意,所以学好英语,尽量搜索英文资料,我相信可以更快地解决你的问题。一个例子是,我的第一段科研经历需要使用一套瓦里安Eclipse计划系统的接口,当时国内厂商并没有提供这方面的培训,后来我通过国外的开发者论坛学习了这套接口内置的众多函数及数据结构,成为科室里早期唯一会使用这套接口的人,国内的工程师有时候反过来需要问我这方面的问题。

刚开始学习编程时无需畏难。我们遇到的问题往往只需较简单的程序语言就可以解决,比如Python就极大的降低了编程的门槛。我只有在做算法类的研究时才会使用C语言,难度确实有,但大部分情况还是编写Python脚本就足以解决问题了。对于我们交叉学科的同学来说,能让代码跑起来最重要,而不是一板一眼地像计算机专业的学生一样去进行各种优化,要记住程序只是个工具,并不是我们的重点,重要的是我们要用它解决什么问题。

最后用一段话总结我的一点体会:我的专业在医学、人文、物理学都有涉猎,但是最后所学都能汇集到一个方向上,正如乔布斯所说,有些东西目前看来毫无价值,但当你把生命中的点点滴滴串联起来,你会发现这些都是你人生最宝贵的财富。不必强求走大众认可的道路,只要一路跟随自己的直觉和内心,就可以做出有价值的事。

但行好事,莫问前途。